En Underwater Cities, que dura entre 30 y 45 minutos por jugador, los jugadores representan los cerebros más poderosos del mundo, cerebros nominados debido a la superpoblación de la Tierra para establecer las mejores y más habitables áreas submarinas posibles.
El principio fundamental del juego es la colocación de las cartas. Se colocan tres tarjetas de colores a lo largo del borde del tablero principal en ranuras de 3 x 5, que también son de colores. Lo ideal es que los jugadores puedan colocar cartas en ranuras del mismo color. Entonces podrán realizar tanto acciones como ventajas: la acción representada en la ranura del tablero principal y también la ventaja de la tarjeta. Las acciones y ventajas pueden permitir a los jugadores consumir materias primas; construir y mejorar cúpulas urbanas, túneles y edificios de producción como granjas, dispositivos de desalinización y laboratorios en su área submarina personal; mover su marcador en el marcador de iniciativa (lo cual es importante para el orden de los jugadores en el siguiente turno); activar las «tarjetas A» del jugador; y coleccionar cartas, tanto especiales como básicas, que permiten mejores posibilidades de decisión durante el juego.
Las casi 220 tarjetas, ya sean especiales o básicas, se dividen en cinco tipos según el modo y el momento de uso. Se planea que las áreas submarinas sean de doble cara, lo que brindará a los jugadores muchas oportunidades de lograr PV y finalmente ganar.
