Al igual que en el juego digital original de Minecraft, en Minecraft: Builders & Biomes los jugadores exploran el Overworld, construyen estructuras y extraen recursos, ganando puntos por estructuras y los biomas conectados más grandes de espacios de bosque, desierto, montaña o tundra nevada en sus tableros de jugador.
Enemigos familiares como Endermen, Creepers y otros mobs también aparecen a lo largo del juego, y deben ser derrotados con las armas recogidas en el tablero. Derrotar a los mobs les otorga puntos a los jugadores además de otorgar premios adicionales. La puntuación del juego se produce a medida que se agotan las capas del cubo de recursos. Tan pronto como se agota la tercera capa, la aventura llega a su fin y gana el constructor con más puntos.
La puntuación se realiza tres veces durante el juego, específicamente después de que se retira el bloque final del primer, segundo y tercer nivel del cubo de bloques de construcción. En la primera ronda, eliges uno de los cuatro biomas (bosque, desierto, montañas o tundra nevada) y puntúas para el área conectada más grande de este bioma en tu tablero de construcción personal. El tablero viene preimpreso con espacios de bioma y, a medida que colocas edificios en este tablero, puedes alterar el bioma de un espacio. En la segunda ronda, eliges uno de tres materiales (madera, arena, piedra u obsidiana) y puntúas para el grupo conectado más grande de estructuras en tu tablero de construcción personal que estén hechas de este material. En la tercera ronda, puntúas para el grupo contiguo más grande de estructuras (decoración, vivienda, casa de animales o puente) de tu elección en tu tablero. Después de anotar en la tercera ronda, suma los puntos de bonificación de los mobs que has recolectado.
